Kadar jo izvaja strokovnjak, stranskih in neželenih učinkov pri akupunkturi skorajda ni, zato jo Svetovna zdravstvena organizacija priporoča pri številnih obolenjih: pri boleznih gibal, bolečinskem sindromu, težavah vratne, prsne, ledvene hrbtenice, pri revmatoidnem artritisu, artrozi ramenskega, komolčnega, kolčnega, kolenskega in skočnega sklepa, pri lumboischialgijah, sindromu »zmrzlega« ramena, teniškem komolcu, osteoartritisih, zlasti pri migrenah in glavobolih, alergijah, sinusitisih in rinitisih.
Akupunktura pri teh obolenjih lajša bolečine, izboljša gibljivost in zavira vnetni odgovor, v kombinaciji s konvencionalnim zahodnim načinom zdravljenja pa lajša bolezenske znake in izboljša kakovost bolnikovega življenja.
Akupunktura se uporablja tudi pri številnih drugih boleznih in poškodbah - odvisno od indikacije.
Najpogosteje se po priporočilih WHO uporablja v bolečinskih sindromih.
Svetovna zdravstvena organizacija (WHO) priznava uporabnost akupunkture v zdravljenju številnih pogostih bolezni, med katerimi so:
- Akutni bronhitis
- Bronhialna astma
- Alergije
- Povišan krvni pritisk
- Težave z očmi (konjuktivitis, slabovidnost)
- Zobobol
- Bolečina po puljenju zoba (po ekstrakciji)
- Gingivitis (vnetje dlesni)
- Akutni in kronični faringitis (vnetje žrela), povezano z bolečinami v grlu
- Krč (spazem) požiralnika
- Kolcanje
- Akutni in kronični gastritis (vnetje želodčne sluznice)
- Povečano, prekomerno izločanje želodčne kisline (hiperacidnost)
- Kronični ulkus dvanajstnika (ublaži bolečino)
- Akutni ulkus dvanajstnika (brez komplikacij)
- Akutni in kronični kolitis
- Zaprtje
- Debelost
- Migrene in ponavljajoči se glavoboli
- Nevralgije, zlasti trigeminusa (obrazni tro-vejni živec) in bolečine povezane z njimi
- Interkostalna nevralgija (draženje medrebernih živcev ali živca)
- Paraliza obraznega živca (zgodnje obdobje, t.j.znotraj 3 do 6 mesecev)
- Pareza/-e in stanja po možganski kapi
- Periferne nevropatije
- Menierjeva bolezen, Tinitus (šumenje, zvonenje v ušesih, vrtoglavice)
- Nevrogeni mehur, inkontinenca
- Močenje postelje (nočna enureza)
- Cerviko-brahialni sindrom
- Zamrzlo rame in bolečine v mišicah ramenskega obroča
- Teniški komolec
- Išias, artritis artroza
- Bolečina v ledvenem delu hrbtenice (Lumbago)
- Bolečine v hrbtu in kolenih
- Osteoartritis
- Sindrom zapestnega prehoda (Syndroma canalis carpi)
- Fibromijalgija
- Sindrom kronične utrujenosti
- Poškodbe in bolečine, povezane z njimi (zvin), tudi športne poškodbe
- Ginekološke težave
- Neplodnost in težave v nosečnosti
- Priprave na porod
- Slabo počutje, ki je neposredno povezano z začetkom menopauze, motnje menstrualnega ciklusa, krči, PMS in motnje v predelu rodil
- Impotenca
- Psihična nestabilnost in težave
- Stres
- Dolgotrajne depresije in druge motnje centralnega živčnega sistema Tesnobnost (anksioznost)
- Nespečnost
- Odvajanje od kajenja in ostalih odvisnosti (nikotin, alkohol in zasvojenosti z drogami)
WHO je naredila ta seznam bolezni, pri katerih akupunktura dokazano pomaga (zahodna medicina zahteva z dokazi podprta dejstva). Vendar ta seznam predstavlja le del težav, pri katerih je akupunktura v resnici uspešna. Kitajci jo namreč uporabljajo na osnovi izkušenj iz prakse in njihove več tisoč let stare tradicije, zato z različnimi kombinacijami akupunkturnih točk pristopijo k skoraj vsaki težavi. Razvrstitev težav v zgornjem stolpcu ni v povezavi z učinkovitostjoi akupunkturnega zdravljenja pri določeni bolezni, saj se vsak primer razlikuje od drugega glede na resnost, obseg in odziv.